MSc i bioinformatik för datateknik

Kandidatgraden ("Laurea Magistrale") i "Bioinformatik för databas genom s" är ett gemensamt initiativ från University of Milan och Politecnico di Milano , och kommer att aktiveras från och med akademiska året 2019-2020.

Sammanfattningsvis syftar den till att bilda "genomforskare" , det vill säga kandidater som kommer att ha tillräcklig kunskap om molekylära grunden för biologiska system. strukturen och funktionen hos biologiska molekyler och hur de deltar i cellulära processer; teknologier och plattformar för analys av genomer; verktygen för bioinformatik och genomisk analys; och de statistiska och beräkningsmetoderna för analys av biomolekylära data.

Inträde är öppet för alla studenter med en bachelorgrad ("Laurea Triennale") antingen i biologi eller bioteknik eller liknande ELLER datavetenskap, teknik, matematik eller fysik.

Genom att delta i kurserna undervisas i BCG-graden lär du dig om:

1. Organisationen av information i genomet och de molekylära och cellulära processerna på grundval av genuttryck och dess reglering.
2. De experimentella metoderna som används för att studera gener och deras funktion i olika modellarter, både prokaryota och eukaryota.
3. De tekniker som används i modern genom- och epigenomisk forskning, som nästa generations sekvenseringsbaserade analyser (genom- och exomsekvensering, RNA-sekvensering, ChIP-Seq och så vidare).
4. Metoder och protokoll för bioinformatisk analys i funktionella genomstudier (genom- och exomsekvensering, RNA-sekvensering, ChIP-Seq och så vidare).
5. De algoritmiska, matematiska och statistiska tillvägagångssätten bakom bioinformatik och genomiska analysverktyg.
6. Databasteknik för lagring och organisering av data.
7. Modellering och analystekniker som används i systembiologi för studier av interaktioner i komplexa biologiska system.

Programmet innehåller, som ett grundläggande steg i studenternas bildande, en praktik i forskningslaboratorier antingen vid University of Milan, Politecnico eller i andra italienska eller utländska forskningsinstitut. Praktikens forskningserfarenhet och dess resultat kommer att beskrivas i en slutlig skriftlig avhandling, som ska diskuteras framför en avhandlingskommitté.

Uppdrag och mål

Den gemensamma magisterexamen i ”Bioinformatics for Computational Genomics” (BCG) från Politecnico di Milano och Università Degli Studi di Milano syftar till att ge sina akademiker en tillräcklig kunskap om de molekylära grundarna för biologiska system; strukturen och funktionen hos biologiska molekyler och hur de deltar i cellulära processer; teknologier och plattformar för analys av genomer; verktygen för bioinformatik och genomisk analys; och de statistiska och beräkningsmetoderna för analys av biomolekylära data.

Därför omfattar BCG-graden aktiviteter som ger djup kunskap om:

• Organisationen av information i genomet och de molekylära och cellulära processerna på grundval av genuttryck och dess reglering.
• De experimentella metoderna som används för att studera gener och deras funktion i olika modellarter, både prokaryota och eukaryota.
• De tekniker som används i modern genomforskning.
• Metoder och protokoll för bioinformatisk analys i funktionella genomstudier.
• Algoritmiska, matematiska och statistiska tillvägagångssätt som ligger bakom bioinformatik och genomiska analysverktyg.
• Databasteknik för lagring och organisering av data.
• Modellering och analystekniker som används i systembiologi för studier av interaktioner i komplexa biologiska system.

ämnen

Università Degli Studi di Milano kommer att erbjuda kurserna inriktade på biologiska ämnen, medan Politecnico di Milano kommer att erbjuda de beräkningsbara.

1: a året

1: a terminen

• Obligatoriska kurser: Organisk kemi; Bioinformatik och beräkningsbiologi
• Valfria kurser: genetik, cellulär och molekylärbiologi; Biokemi; Programmering och databaser; Statistik

2: a termin

• Obligatoriska kurser: Genomics och transcriptomics; Vetenskaplig programmering; Maskininlärning; biostatistik

2: a året

1: a terminen

• Obligatoriska kurser: Avancerad genomik och epigenomik; Strukturell kemi; Systembiologi och nätverksanalys
• Valbara kurser: Tvärvetenskapligt projekt; Genomisk Big Data Management och Computing

Karriärmöjligheter

BCG-magisterexamen syftar till att utbilda ”dataforskare”, högkvalificerade yrkesverksamma som kan slå samman fördjupad kunskap om de molekylära grunderna för biovetenskap med aktuell kunskap om nuvarande tekniker och tekniker för bioinformatik och genomanalys. Särskild tonvikt kommer att läggas på de kvantitativa och beräkningsaspekterna av de senare, som kommer att fokuseras på analys, modellering och förståelse av biologiska system. Det ultimata målet är att utbilda yrkesverksamma i ett tvärvetenskapligt sammanhang som är redo att hantera de utmaningar som kommer från moderna biomolekylära vetenskaper under den postgenomiska eran, och kunna konjugera och integrera kunskap om biologi, genetik, datavetenskap, informationsteknik och statistik inom olika områden inom grundforskning eller tillämpad forskning.

Kandidater i BCG kommer således att kunna:

• Delta i utformningen och genomförandet av storskaliga genomiska analyser.
• Identifiera och extrahera den biologiska betydelsen ur de erhållna resultaten.
• Designa verktyg och protokoll för bioinformatisk analys av olika typer av experimentella data autonomt.
• Spela en central roll i forskargrupper som fokuserar på grundläggande eller tillämpad genomforskning.
• Koordinera och övervaka forskningsprojekt och grupper med fokus på bioinformatik och genomik.

Tillträde

Förutsättningen för att få tillgång till BCG-magisterprogrammet är en kandidatexamen ("Laurea Triennale") som ger tillräcklig kunskap om antingen (1) genetik, molekylärbiologi och biokemi eller (2) datavetenskap, informationsteknik och matematik. Dessutom krävs kunskaper i engelska som anges nedan. Studenter som fortfarande inte har avslutat sin kandidatexamen kan ansöka om de planerar att ta examen före 31 oktober 2019 (se nedan).

För läsåret 2019-2020 kommer högst 50 studenter att komma in i programmet , valt utifrån bakgrundskunskaper och en personlig intervju.

Förkunskapskrav

Förkunskapskrav för italienska studenter

Italienska studenter kan ansöka om BCG-masterexamen, förutsatt att de uppfyller något av följande två krav:

• De har genomfört ett kandidatexamen (Laurea Triennale) i en av följande klasser:
  • Bioteknik (klass L2)
  • Biologi (klass L13)
  • Jord- och livsmedelsvetenskap (klass L26)
  • Farmakologiska vetenskaper (klass L29)

och under sina studier har de fått minst 30 CFU i biologiska områden (SSD BIO) med minst 18 CFU i genetik (BIO / 18), Molecular Biology (BIO / 11) och Biochemistry (BIO / 10)

ELLER

• De har genomgått ett kandidatexamen (Laurea Triennale) i en av följande klasser:
  • Informationsteknik (klass L8)
  • Datavetenskap (klass L31)
  • Fysik (klass L30)
  • Matematik (klass L35)

och under sina studier har de förvärvat minst 30 CFU inom datavetenskap, informationsteknik, biomedicinsk teknik, matematik och / eller statistik (SSD INF / 01, ING-INF / 05, ING-INF / 06, MAT / 01 -09 och / eller SECS-S / 01), med minst 6 CFU i matematik (MAT / 01-09) och minst 12 CFU på ett eller flera av följande områden: datavetenskap (INF / 01) ingenjörskonst (ING-INF / 05), biomedicinsk teknik (ING-INF / 06), statistik (SECS-S / 01).

Samma kriterier tillämpas på kandidater som har utländska universitetsexamen som anses lämpliga av lärarrådet, där det är möjligt att tydligt identifiera discipliner och antal krediter som förvärvats för respektive disciplin. Om detta inte är möjligt kommer de dokument som intygar karriären för kandidaterna att granskas i detalj av lärarrådet för att bedöma om bakgrunden överensstämmer med tidigare krav.

Grundstudenter kan ansöka men måste få sin kandidatexamen (Laurea Triennale) före den 31 oktober 2019.

Förkunskapskrav för utländska studenter

• Studenter som har en kandidatexamen i ett område av de som beskrivs i föregående punkt (Krav för italienska studenter), där kurser i de obligatoriska disciplinerna tydligt kan identifieras tillsammans med antalet timmar / poäng på kurserna. Om detta inte är möjligt kommer dokumenten som bekräftar studenternas karriär att granskas av lärarrådet för att bedöma om deras bakgrund uppfyller de tidigare kraven.

Språkkrav

• Studenter måste kunna engelska, med en B2-kompetensnivå. Studenter som redan är inskrivna vid universitetet i Milano, som inte har ett B2-certifikat eller motsvarande, uppmanas att ta ett placeringstest för att bevisa sin kompetensnivå och bevisa det under intervjun. I undantagsfall kan studenter utan B2-placeringstest accepteras under förutsättning att deras kunskapsnivå, bedömd under intervjun, uppenbarligen är god.
• Kunskaper i italienska är inte nödvändiga för närvaro. I enlighet med föreskrifterna måste utländska studenter dock visa att de har förvärvat grundläggande kunskaper i det italienska språket före avhandlingen.

Urval och rangordning

Studenter som uppfyller ovanstående förutsättningar kommer att få delta i en intervju med ledamöter för bedömning av sin vetenskapliga bakgrundskunskap.

De lämpliga personliga förberedelserna för kandidaterna (i deras bakgrundsämnen), deras förmåga att kommunicera på engelska och deras motivation är avgörande för antagningen. Intervjun kommer att utvärdera kandidatens expertis inom ämnen relaterade till kandidatexamen.

Utskottet ska utvärdera varje sökande på 100-poängsskala:

• Upp till 50/100 poäng kommer att tilldelas för sökandens CV (typ av kandidatexamen deltog, examen betyg, ytterligare kurser deltog, ytterligare grader etc.)
• Upp till 50/100 poäng kommer att tilldelas för intervjun.

Minsta poäng som krävs för antagning är 60/100.

För läsåret 2019-2020 kommer intervjuer för italienska studenter och utländska studenter som är bosatta i Italien att äga rum vid Institutionen för biovetenskaper, Via Celoria 26, den 16 juli 2019, klockan 9.30.

Utländska sökande som inte är bosatta i Italien och har uppnått sin kandidatexamen utomlands kan välja en onlineintervju. I början av intervjun måste studenter visa ett giltigt ID-kort eller pass för identifiering.

Inskrivning efter tillträde

När resultaten har publicerats måste studenter som upptar de första 50 positionerna i meritrankningen slutföra sin anmälan inom den tidsfrist som anges i tävlingsmeddelandet. Därefter, om de första 50 lediga tjänsterna efter den inledande tidsfristen inte är mättade, kommer inskrivning att vara möjlig för studenter med lägre meritrankning, förutsatt att de har uppnått minst 60/100 i antagningsprovet. Anmälan till studenter godkänns endast om de erhåller sin kandidatexamen (Laurea Triennale för italienska studenter) senast den 31 oktober 2019. Studenter från andra universitet måste, efter examen senast den 31 oktober 2019, uppvisa certifiering av den tilldelade examen vid Segreteria Studenti.

Ämnen

Università Degli Studi di Milano kommer att erbjuda kurser fokuserade på biologiska ämnen, medan Politecnico di Milano kommer att erbjuda beräkningskurser.

1:a året

1:a terminen

• Obligatoriska kurser: Organisk kemi; Bioinformatik och beräkningsbiologi
• Valbara kurser: Genetik, cell- och molekylärbiologi; Biokemi; Programmering och databaser; Statistik

2:a terminen

• Obligatoriska kurser: Genomik och transkriptomik; Vetenskaplig programmering; Maskininlärning; Biostatistik

2:a året

1:a terminen

• Obligatoriska kurser: Avancerad genomik och epigenomik; Strukturkemi; Systembiologi och nätverksanalys
• Valbara kurser: Tvärvetenskapligt projekt; Genomisk Big Data Management och Computing

QS Ranking 2023 (juni 2022)

• 1:a i Italien
• 139:a i världen

Genom att delta i kurserna i BCG-examen kommer du att lära dig om:

1. Organisationen av information i genomet och de molekylära och cellulära processerna på grundval av genuttryck och dess reglering.
2. De experimentella metoder som används för att studera gener och deras funktion i olika modellarter, både prokaryota och eukaryota.
3. Teknikerna som används i modern genomisk och epigenomisk forskning, som nästa generations sekvenseringsbaserade analyser (genom- och exomsekvensering, RNA-sekvensering, ChIP-Seq, och så vidare).
4. Metoder och protokoll för bioinformatisk analys i funktionell genomikstudier (genom- och exomsekvensering, RNA-sekvensering, ChIP-Seq, och så vidare).
5. De algoritmiska, matematiska och statistiska metoderna bakom bioinformatik och genomisk analysverktyg.
6. Databasteknologier för lagring och organisation av data.
7. Modellerings- och analystekniker som används inom systembiologi för studiet av interaktioner i komplexa biologiska system.

Programmet inkluderar, som ett grundläggande steg i bildandet av studenterna, en praktikplats i forskningslaboratorier antingen vid universitetet i Milano, Politecnico eller i andra italienska eller utländska forskningsinstitut. Praktikens forskningserfarenhet och dess resultat kommer att beskrivas i en avslutande skriftlig avhandling, som ska diskuteras inför en avhandlingskommitté.

BCG-magisterexamen syftar till att utbilda "datavetare", högutbildade yrkesmän som kan sammanfoga djupgående kunskaper om biovetenskapernas molekylära grunder med aktuell kunskap om nuvarande tekniker och teknologier för bioinformatik och genomisk analys. Särskild vikt kommer att läggas på de kvantitativa och beräkningsmässiga aspekterna av de senare, som kommer att fokuseras på analys, modellering och förståelse av biologiska system. Det slutliga målet är att i ett tvärvetenskapligt sammanhang utbilda yrkesverksamma som är redo att klara av utmaningarna från moderna biomolekylära vetenskaper i den postgenomiska eran och kunna konjugera och integrera kunskap om biologi, genetik, datavetenskap, informationsteknik och statistik inom olika områden av grundforskning eller tillämpad forskning.

Utexaminerade i BCG kommer således att kunna:

• Ta del av design och genomförande av storskaliga genomiska analyser.
• Identifiera och extrahera den biologiska betydelsen från de erhållna resultaten.
• Designa verktyg och protokoll för bioinformatisk analys av olika typer av experimentell data autonomt.
• Spela en central roll i forskargrupper fokuserade på grundläggande eller tillämpad genomforskning.
• Koordinera och handleda forskningsprojekt och grupper inriktade på bioinformatik och genomik.